Храм двухэтажный. Нижний храм освящен в честь Трех Святителей, Василия Великого, Григория Богослова, Иоанна Златоустого, верхний - в честь Преображения Господня.

В 1992 году 7 июля на праздник Рождества Иоанна Предтечи Владыкой Тихоном (Емельяновым), Епископом Новосибирским и Барнаульским было совершено освещение закладного камня и места для строительства нового храма, ныне Преображенского кафедрального собора.

Нижний храм освящен покойным Епископом Сергием (Соколовым) в начале января 1998 года.

На его территории, напротив алтаря, находятся могилы дорогих нашему сердцу Архимандрита Макария (Реморова) (-I- 08.12.1998) и Епископа Сергия (Соколова) (-I- 20.10.2000), первого Епископа Новосибирского и Бердского. Освящение верхнего храма совершил Архиепископ Новосибирский и Бердский Тихон (Емельянов) на Благовещение 2001 года.

С этого времени началось богослужение в верхнем храме. Иконостас установили в Вербное воскресенье 28 апреля 2002 года. Богослужения в нижнем храме совершались с 1998 года. 8 конце августа 1998 года привезли в Бердск колокола с Урала. Почти на полный подбор колоколов удалось собрать денег всем миром. Девять колоколов в Бердской звоннице. Первый колокольный звон бердчане услышали 13 сентября 1998 года.

В настоящее время в храме продолжаются отделочные работы. Преображенский собор строится по проекту Новосибирского архитектора Петра Чернобровцева, автора часовни святителя Николая на Красном проспекте, Знаменской церкви на Учительской, храма «Утоли моя печали» на Клещихе в городе Новосибирске.

В Преображенском соборе много чтимых икон и святынь:

* Икона Благовещение. Эту икону перед праздником Благовещение Пресвятой Богородицы принесли прихожане в 2001 году. Икона из старого, разрушенного Сретенского храма.
* Казанская икона Божией Матери (риза вышита и украшена монахиней Зоей)
* Храмовые иконы: Преображения Господня и икона Трёх святителей. Одну из икон Трех Святителей написала Наталья Николаевна Соколова, мама покойного Владыки Сергия.
* Иконы, подаренные Владыкой Сергием: Христа Спасителя, Пресвятой Богородицы, святителя Николая Чудотворца
* Стопа Богородицы, привезённая отцом Василием из Почаевского монастыря

Богослужения проходят каждые субботу и воскресение и в праздничные дни.